重庆南开中学创建于1936年，是著名爱国教育家张伯苓先生创办的南开系列学校之一。南开学校肇始于天津。张伯苓原为北洋水师见习军官，目睹了甲午战败后“国帜三易”的悲愤一幕，立志教育救国。1904年，他在清翰林严修的帮助下建成天津南开中学，后来又于1919年创办南开大学，于1923年创办南开女中，于1927年创办南开经济研究所。“九一八”事变后，华北形势危急。为了保证教育工作不因时局变化而中断，并实现将南开学校办到全国各地的理想，张伯苓校长决定在四川建中学，选址重庆沙坪坝。学校初名南渝中学，取南开在渝办学之意。1937年，天津南开中学和南开大学被日机炸毁，“为了表示南开生命之延续，以及不屈之决心”，张伯苓校长在校董会的建议下，于1938年将南渝中学更名为私立重庆南开中学。1953年，学校由私立改为公办，更名为重庆三中。1984年，重庆三中恢复南开校名，并由邓颖超同志题写了校牌。目前，学校是直属重庆市教委管理的公办高完中、重庆市重点中学。

自建校以来，重庆南开中学就因爱国和教学质量高而闻名。抗战期间，毛泽东、周恩来、华莱士等政要多次光临南开中学，重庆南开是抗战时期中国基础教育的典范。

建校79年来，学校先后为社会输送了6万余名祖国各个领域的骨干。他们中有20余位国家和省部级领导，有33位院士，有将军、教授、艺术家和经济学家等。国家领导人邹家华，中国科学院院长周光召，中国工程院院长朱光亚，国家自然科学基金会主任张存浩，著名科学家邹承鲁，著名经济学家吴敬琏、茅于轼，著名理论家郑必坚，著名词作家阎肃，南极科学考察队队长颜其德，“大爱铸忠魂”的中华信仰楷模冯理达，中华骨髓库跨国捐髓第一人吴渝，抗震救灾中“最美的微笑”盛于峰，2009年感动重庆十大人物庹蓝兰，2013年中国最美村官秦玥飞等人都是重庆南开中学的校友。

重庆南开中学坚持全面推进素质教育，不断提高教育质量。自20世纪80年代开始，南开中学就率先以课程设置改革为突破口，探索学校内涵发展、特色建设的新途径。目前学校已经建立起了有南开特色的必修课－选修课－自修课和学科课程－活动课程－隐性课程有机结合、相互补充的课程体系。南开中学每学期开设40余门选修课，特色活动课程“南开讲坛”邀请了中科大校长朱清时、香港理工大学校长潘宗光，以及北大、清华、人大、南京大学等著名高校的院士、教授、学者前来演讲，每周一讲，已逾230讲，并正式出版了《南开大讲堂》第一辑、第二辑。

学校的体育、艺术、科技活动丰富多彩，成果突出。女子篮球、田径、排球、足球、网球、板球、棒球、高尔夫球、乒乓球、跆拳道、国际象棋等运动队，在各种竞技中屡创佳绩。艺术方面，合唱、民乐、管乐、舞蹈等团队有着很高的表演水平，多次获奖。科技活动丰富多彩，2005年以来，3人荣获中国青少年科技创新奖，21人获得重庆市青少年科技创新市长奖或市长奖提名奖，60余人次获国家级科技创新奖项，近500名学生在各种科技比赛中获得奖励。

南开中学秉持“允公允能，日新月异”的校训，坚持以培养高层次、高素质、创新型人才为方向，使学生既全面发展，又学有特长。多年来，重庆南开中学的重点大学升学率都遥居全市榜首。1997年重庆直辖以来，南开中学有759名学生考入北京大学、清华大学，4000余名学生考取了“985”重点大学。由于出色的办学业绩，重庆南开中学被誉为“中学里的大学”和“办中学的一面镜子”。

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